MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	TAA	3	9	12	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009633	CA	3	6	199	204	50 %	0 %	0 %	50 %	150387854
3	NC_009633	GTA	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
4	NC_009633	AGA	2	6	335	340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387854
5	NC_009633	CTGTGG	2	12	450	461	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150387854
6	NC_009633	TTTA	2	8	494	501	25 %	75 %	0 %	0 %	150387854
7	NC_009633	AATG	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	150387854
8	NC_009633	AATT	2	8	615	622	50 %	50 %	0 %	0 %	150387854
9	NC_009633	TGA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
10	NC_009633	TGA	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
11	NC_009633	ATTCA	2	10	698	707	40 %	40 %	0 %	20 %	150387854
12	NC_009633	AAAG	2	8	716	723	75 %	0 %	25 %	0 %	150387854
13	NC_009633	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387854
14	NC_009633	TAA	2	6	769	774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387854
15	NC_009633	AGA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387854
16	NC_009633	CCT	2	6	875	880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150387854
17	NC_009633	A	6	6	911	916	100 %	0 %	0 %	0 %	150387854
18	NC_009633	A	8	8	967	974	100 %	0 %	0 %	0 %	150387854
19	NC_009633	TTG	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387854
20	NC_009633	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387854
21	NC_009633	TAA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387854
22	NC_009633	GGT	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150387854
23	NC_009633	A	6	6	1178	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	150387854
24	NC_009633	TC	5	10	1246	1255	0 %	50 %	0 %	50 %	150387854
25	NC_009633	CGA	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387854
26	NC_009633	ATGC	2	8	1301	1308	25 %	25 %	25 %	25 %	150387854
27	NC_009633	TCC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009633	GTTTT	2	10	1516	1525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009633	TAC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009633	TAC	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009633	TTTA	2	8	1587	1594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009633	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009633	GAGG	2	8	1611	1618	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009633	AGGA	2	8	1816	1823	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
35	NC_009633	TTG	4	12	1825	1836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
36	NC_009633	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387855
37	NC_009633	TAG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
38	NC_009633	ATT	2	6	2024	2029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387855
39	NC_009633	GAT	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
40	NC_009633	GT	3	6	2095	2100	0 %	50 %	50 %	0 %	150387855
41	NC_009633	GTT	3	9	2199	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
42	NC_009633	GAA	3	9	2253	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387855
43	NC_009633	AAT	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387855
44	NC_009633	CTG	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387855
45	NC_009633	AATT	2	8	2317	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
46	NC_009633	ATTA	2	8	2349	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
47	NC_009633	TTA	2	6	2439	2444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387855
48	NC_009633	AAGG	2	8	2448	2455	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
49	NC_009633	TGT	2	6	2477	2482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
50	NC_009633	ATG	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
51	NC_009633	GAT	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
52	NC_009633	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387855
53	NC_009633	GTTT	2	8	2631	2638	0 %	75 %	25 %	0 %	150387855
54	NC_009633	ATA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009633	AGG	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009633	AAG	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387856
57	NC_009633	TAG	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387856
58	NC_009633	TTG	2	6	2991	2996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387856
59	NC_009633	ATT	2	6	2998	3003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387856
60	NC_009633	TGA	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387856
61	NC_009633	TAAAGT	2	12	3010	3021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150387856
62	NC_009633	TAA	2	6	3038	3043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009633	TAAA	2	8	3071	3078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009633	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009633	GTA	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009633	ATA	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
67	NC_009633	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
68	NC_009633	CAACTT	3	18	3160	3177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387857
69	NC_009633	TAAAG	2	10	3330	3339	60 %	20 %	20 %	0 %	150387857
70	NC_009633	AG	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	150387857
71	NC_009633	ATA	2	6	3356	3361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
72	NC_009633	AGA	2	6	3389	3394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387857
73	NC_009633	CTT	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387857
74	NC_009633	TTGTT	2	10	3455	3464	0 %	80 %	20 %	0 %	150387857
75	NC_009633	ATT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
76	NC_009633	GA	3	6	3505	3510	50 %	0 %	50 %	0 %	150387857
77	NC_009633	ATA	2	6	3575	3580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
78	NC_009633	AAAC	2	8	3597	3604	75 %	0 %	0 %	25 %	150387857
79	NC_009633	A	7	7	3624	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	150387857
80	NC_009633	ATT	2	6	3682	3687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
81	NC_009633	T	6	6	3834	3839	0 %	100 %	0 %	0 %	150387857
82	NC_009633	GAA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387857
83	NC_009633	TGA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387857
84	NC_009633	CAG	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387857
85	NC_009633	TAA	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
86	NC_009633	TGA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387857
87	NC_009633	AT	3	6	4096	4101	50 %	50 %	0 %	0 %	150387857
88	NC_009633	ACA	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387857
89	NC_009633	AAC	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009633	TAT	3	9	4250	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009633	TAA	2	6	4272	4277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009633	GAG	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009633	TTC	2	6	4314	4319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387858
94	NC_009633	AGG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387858
95	NC_009633	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	150387858
96	NC_009633	GAA	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387858
97	NC_009633	TTAT	2	8	4533	4540	25 %	75 %	0 %	0 %	150387858
98	NC_009633	AATT	2	8	4614	4621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009633	AGG	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009633	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387859
101	NC_009633	GTT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
102	NC_009633	GGA	4	12	4970	4981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387859
103	NC_009633	TGT	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
104	NC_009633	GTTGAA	2	12	5045	5056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387859
105	NC_009633	AAG	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
106	NC_009633	TA	3	6	5202	5207	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
107	NC_009633	T	6	6	5239	5244	0 %	100 %	0 %	0 %	150387859
108	NC_009633	GA	3	6	5269	5274	50 %	0 %	50 %	0 %	150387859
109	NC_009633	AGA	3	9	5281	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
110	NC_009633	ATG	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387859
111	NC_009633	ATTT	2	8	5381	5388	25 %	75 %	0 %	0 %	150387859
112	NC_009633	GTT	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
113	NC_009633	AT	3	6	5454	5459	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
114	NC_009633	TAAT	2	8	5535	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
115	NC_009633	GAAA	2	8	5569	5576	75 %	0 %	25 %	0 %	150387859
116	NC_009633	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387859
117	NC_009633	TTG	2	6	5703	5708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
118	NC_009633	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387859
119	NC_009633	A	7	7	5815	5821	100 %	0 %	0 %	0 %	150387859
120	NC_009633	AGA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
121	NC_009633	TA	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
122	NC_009633	CTG	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387859
123	NC_009633	TAGA	2	8	6033	6040	50 %	25 %	25 %	0 %	150387859
124	NC_009633	CTGATG	2	12	6147	6158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150387859
125	NC_009633	ATT	3	9	6181	6189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387859
126	NC_009633	CTTT	2	8	6192	6199	0 %	75 %	0 %	25 %	150387859
127	NC_009633	T	6	6	6197	6202	0 %	100 %	0 %	0 %	150387859
128	NC_009633	AT	3	6	6205	6210	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
129	NC_009633	TA	3	6	6237	6242	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
130	NC_009633	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150387859
131	NC_009633	TA	3	6	6258	6263	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
132	NC_009633	A	7	7	6268	6274	100 %	0 %	0 %	0 %	150387859
133	NC_009633	A	6	6	6315	6320	100 %	0 %	0 %	0 %	150387859
134	NC_009633	AAC	2	6	6387	6392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387859
135	NC_009633	GAT	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387859
136	NC_009633	AAG	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
137	NC_009633	AT	3	6	6552	6557	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
138	NC_009633	GAT	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
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